Olá @diogo1989rodrigues 

Sugiro que veja no seu myMEO o preço que aparece lá que lhe falta pagar.

Por vezes, quando se paga após o prazo, por erro pode aparecer para pagar outra vez na fatura seguinte

Mas se já fez o pagamento, e aparecer a fatura anterior paga no myMEO, Não se percisa de preocupar, só percisa de pagar o valor da fatura deste mês, como indica no myMEO.

Veja quando foi emitida a fatura. No dia da emissão, provavelmente ainda não estava processado o pagamento, e por isso não foi considerado no valor total da fatura.